随着我国区域自主创新活动日益活跃,自主创新能力对区域经济增长的推动作用日益增强。本文在借鉴国内外有关自主创新理论和实践的基础上,本文从区域自主创新效率与其影响因素两个角度,对长株潭区域自主创新效率作出了全面研究分析。本文对我国区域自主创新的基本概念和自主创新效率测评进行重新界定,构建区域自主创新效率研究的理论分析框架。在理论分析基础上构建区域自主创新效率评价指标体系,运用DEA-Malmquist方法对长株潭区域自主创新效率进行综合测评,以及与武汉东湖示范区、中关村示范区、苏南示范区的自主创新效率相比较,分析长株潭区域自主创新效率的动态演化趋势。其次,根据自主创新效率影响因素理论基础分析,选取经济发展水平、研发经费投入、研发人力投入、外商直接投资、政府投入等5项指标构建面板数据回归模型,分析影响长株潭区域自主创新效率的内外部因素,并且与武汉东湖示范区、中关村示范区、苏南示范区的自主创新效率影响因素进行对比分析。分析比较不同因素在长株潭区域以及其他区域内作用的差异,揭示长株潭区域自主创新效率的内在影响因素,有针对性地提出提高长株潭区域自主创新效率的对策建议。