鸡PNPLA3基因多态性及组织表达规律的研究

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PNPLA3(脂肪细胞营养素)是近几年发现的与能量平衡和脂肪代谢有关的非分泌型蛋白,作为PNPLAs家族的一员,PNPLA3同时具有脂肪分解酶活性和脂肪转移酶活性。在人PNPLA3基因的研究发现该基因在脂肪合成和分解代谢中有重要作用,与人的体重增长及肥胖等密切相关。目前尚未见该基因遗传变异对鸡生长发育及代谢影响的报道。本研究主要进行了鸡PNPLA3基因遗传变异与固始鸡资源群经济性状的关联分析及该基因在丝毛乌骨鸡不同生长阶段的组织表达差异研究。本试验利用混合DNA池测序技术对鸡PNPLA3基因全长序列变异位点进行了筛选,用PCR-RFLP技术分析了筛选出的变异位点在固始鸡安卡鸡F2代资源群中的分布及群体遗传特性,用SHEsis软件进行突变位点之间的连锁不平衡分析,PHASE2.0软件进行单倍型构建。并进行了各突变位点及单倍型与生长性状、屠体性状、肉质性状等经济性状及血液生化指标的关联分析,同时进行了各突变位点对其显著相关性状的加性效应与显性效应研究。采用实时定量PCR技术对丝毛乌骨鸡PNPLA3基因不同生长阶段的组织表达进行了测定。主要结果如下:1、在鸡PNPLA3基因第6外显子、第7内含子、第8外显子共发现3处突变位点,分别命名为g.40006G>T、g.42344T>C和g.42404A>T,其中,g.40006G>T突变位点导致了氨基酸的变化(赖氨酸→天冬酰胺)。群体遗传学研究表明,三个位点的突变纯合型个体均较少,基因型频率较低。3个位点的多态信息含量均在0.25到0.5之间,均属于中度多态。2、位于第7内含子的g.42344T>C位点与第8外显子的g.42404A>T位点处于强连锁不平衡状态,这两个位点构成3种单倍型(频率>0.01%):H1(C-T)、H2(T-T)、H3(T-A),其中C-T型频率最高,达到74.8%。3、关联分析结果表明:3个位点均与体重、屠体重及主要内脏器官重存在显著关联(P<0.05),且具有明显的优势基因型,而与腹脂重、腹脂率等脂肪性状的相关性不显著(p>0.05)。g.40006G>T位点对显著相关的体重及屠体性状具有显著的加性效应(p<0.05),而g.42344T>C和g.42404A>T位点对其相关性状的显性效应显著(p<0.05)。单倍型组合型与10周龄体重、12周龄体重、屠体重等生长性状和屠体性状显著相关(p<0.05)。4、在对乌鸡公鸡1日龄,4、8、12周龄的肝脏、心脏、肌肉的的PNPLA3的表达研究发现,1日龄、4周龄、12周龄时,PNPLA3基因均在肝脏中表达量最高,其中12周龄的肝脏表达量显著高于肌肉和心脏组织(P<0.05);PNPLA3基因在肝脏中的表达随着生长发育呈现出先减少后增加的趋势,在12周龄时表达量达到最高,而在肌肉和心脏中的表达呈现出增加—减少—增加的趋势。由以上试验结果,可得出如下结论:1、鸡PNPLA3基因g.40006G>T、g.42344T>C和g.42404A>T突变位点均与生长性状及屠体性状存在显著关联,可能与控制生长性状的QTL或主效基因连锁。g.40006G>T位点对相关性状的加性效应显著,可用于纯系育种工作中提高固始鸡的生长性能。2、丝毛乌骨鸡PNPLA3基因在不同组织中具有不同的表达变化规律,该基因在肝脏中的表达普遍高于其它组织,推测其可能是通过肝脏对机体代谢产生作用。
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