融合酶药效团模型构建及芳香二酮类化合物的设计与合成

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获得性免疫缺陷综合征(Acquired Immune Deficiency Syndrome,AIDS)简称艾滋病,是由人免疫缺陷病毒(HIV)感染引起、严重威胁人类健康的传染病。整合酶在HIV-1的生命周期中发挥着必不可少的作用,被认为是设计抗艾滋病药物的一个理想靶点。  由于HIV-1整合酶的晶体结构还未见报道,而基于配体的药效团模型法是虚拟筛选设计药物分子的有效方法。所以本文首先根据文献报道的HIV-1整合酶抑制剂的结构与生物活性数据,利用Discovery studio 3.1软件中Pharmacophore模块下3DQSAR Pharmacophore Generation这一模块构建了10个药效团模型,然后运用多种评价方法(如Fischer随机模型法),依据各个模型预测活性值与实验实测活性值的对比结果及模型的各个参数值(如Cost值等),最后得到评价效果最好的三维整合酶抑制剂的药效团模型,该模型的R为0.973,含有三个氢键受体特征和一个芳香疏水特征,是合理有效的药效团模型,可以用来进行化合物的筛选。随后我们利用这一模型对剑桥小分子化合物库进行活性化合物的筛选,以期望能够快速发现新的HIV-1整合酶抑制剂的先导化合物。  整合酶作为靶点的药物开发是当前抗HIV药物研究的热门,而二酮酸类(DKA)是目前对整合酶抑制剂研究中最为成功的一类。基于对二酮酸作为主要的活性基团与整合酶的结合方式的认知,同时结合经典的DKA类HIV-1整合酶抑制剂的药效团模型,考虑设计并合成了以1,3-二酮为主要活性基团的毛叶假鹰爪的类似物。并且根据药物设计学中类似拼合原理,设计在1,3-二酮结构的另一侧接上咖啡酸的有效基团,以期望能够使活性增加。首先利用第二章所产生的最佳药效团模型对目标化合物进行生物活性预测,而后运用分子对接的方法,对设计出的目标化合物与整合酶的结合方式进行研究,预测结果表明,目标化合物均具有一定程度的抑制HIV-1作用,且与IN结合的位置和5-CITEP结合到IN的位置大概一致,能够阻止病毒DNA与IN的结合。最后选用MAGI实验方法对样本的抗HIV-1活性进行测定,结果显示,目标化合物对整合酶均具有一定程度的抑制作用。
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