随着市场经济体制的深化改革,使得企业之间的竞争方式发生了彻底性的改变,从单一竞争变为合作竞争,尤其在企业供应链管理中表现的更加明显。供应链节点企业为使得自身收益增加,经营方式从个体经营方式转变为合作经营,从竞争走向竞合。而合作之后的利益分配问题往往是企业最为关心的问题,如何设置合理的分配机制是供应链节点企业之间合作是否长久的关键,也是控制供应链风险的关键。本文首先针对制造商和零售商组成的二级供应链,利用Stackelberg模型中的逆向求解方法比较了在非合作博弈和合作博弈情况下供应链整体收益,得到了合作之后的收益要大于不合作时收益的结论,并给出算例分析。其次利用合作博弈中的Shapley值分配方法针对二级供应链节点企业建立分配模型,并通过引入带节点企业贡献率的修正因子来改进Shapley值模型,使得分配结果更加合理、科学。最后结合演化博弈模型针对市场风险因子、供应链中制造商与零售商合作的诚信度和合作之后的毁约金来分析双方策略演化路径,最后得到演化稳定策略,并通过演化路径给出具体的建议与对策。论文通过上述三方面的论述来说明合作的必要性,从根本上分析供应链风险形成的主要因素,并结合风险因素给出合理的解决方案和建议,为供应链风险控制提供决策参考。