隼属鸟类是猛禽中的重要类群，许多种类为重要的受保护物种。以往的研究主要集中在分布、形态等方面，关于分子生态学方面的研究较少。本研究采用PCR后直接测序的方法，对隼属鸟类的进化关系以及代表物种红隼(Falcotinnunculus)的系统地理学及种群遗传结构进行了分析。 细胞色素b是进行属和种阶元鸟类分类和进化研究中常用的分子标记。本研究通过PCR及测序，得到了猎隼(Falcocherrug)、燕隼(F.subbuteo)、红脚隼(F.amurensis)和灰背隼(F.columbarius)4种隼属鸟类的细胞色素b部分序列，从Genebank上下载到了游隼(F.peregrinus)、西红脚隼(F.vespertinus)、黄爪隼(F.naumanni)等11种隼属鸟类，及做为外群的红颊小隼(Microhierax.erythrogonys)的细胞色素b序列，通过MAGE、Phylip等程序建立了分子系统树。红脚隼和西红脚隼间的遗传距离为0.0301，已经超过了近缘物种的一般分化分度，和猎隼(Falcocherrug)、游隼(Falcoperegrinus)间的分化程度在一个数量级上。综合形态差异和行为特征，中国及东亚地区分布的红脚隼应被认为是独立的种，而不只是西红脚隼的亚种。参考鸟类的线粒体DNA进化速率，两个物种应该在约四百三十万年前到一百五十万年前分开。 红隼是广布于欧亚大陆的小型隼类，中国境内有2-3个亚种分布。本研究收集了北京和山东的红隼样品46份，对其线粒体DNA控制区约400bp的序列进行了分析，共发现了12个单倍型，可以明显的分成两大类型，对应红隼的两个亚种——普通亚种(F.t.interstinctus)和指名亚种(F.t.tinnunculus)。北京地区分布的红隼，夏季均为普通亚种，冬季13个个体中有5个属于指名亚种。这不同于传统观点认为的北京冬季均为指名亚种。通过对北京种群的群体遗传结构分析，发现北京种群遗传结构处于稳定状态，可能和红隼对城市生活的适应有关。