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兰州鲇(Silurus lanzhouensis),又名黄河鲶,是黄河中上游特有的优质经济鱼类,因其肉质细嫩、刺多肉少、营养价值高等优点,深受养殖户和消费者的喜爱,市场需求量大,消费市场前景广阔。但是目前兰州鲇野生种群数量日益减少,养殖群体选育程度较低。鉴于此,本研究采用EST-SSR标记技术开展兰州鲇遗传多样性研究;运用基因克隆技术开展兰州鲇核糖体蛋白质L15(RPL15)基因完整CDS区、生肌决定因子Myf5(Myf5)基因部分CDS区生物信息学分析,同时采用实行荧光定量法分析上述两个基因在兰州鲇8个不用组织、不同性别个体间的表达;采用TA克隆和单链构象多态性的方法,分析兰州鲇生肌决定因子MyoD(MyoD)基因、肌细胞生成素MyoG(MyoG)基因的SNPs和多态性,筛选出与生长有关的标记位点。通过以上研究为今后兰州鲇分子标记辅助选育和基因工程育种技术奠定了一定的理论基础和技术支撑,并取得以下研究结果:试验一:获得 218 个 EST-SSR 序列,GenBank 登录号:JZ84579-JZ845687;JZ845227-JZ845367;81个不含SSR的EST序列,GenBank登录号:JZ845478-JZ84559。根据侧翼序列设计出299对引物,选取53对进行扩增检验,有22对引物可扩增出目的条带,用PAGE-银染法在100尾兰州鲇个体间进行多态性检测,发现11个EST-SSR位点具有多态性。试验二:首次克隆测序获得兰州鲇RPL15基因的完整CDS区序列长度为615bp(GenBank登录号:KT1969343)和Myf5基因的部分cDNA序列长度为477 bp(GenBank登录号:KT580948)。RPL15基因编码由355个氨基酸残基组成的可溶碱性蛋白质。通过荧光定量PCR分析兰州鲇RPL15基因主要在脑组织和肝组织中特异性表达,且脑组织和肝组织极显著的高于其它组织(P<0.01)。脑组织RPL15的表达雌鱼显著高于雄鱼(P<0.05)。兰州鲇Myf5基因编码由122个氨基酸残基组成的可溶酸性蛋白质。兰州鲇Myf5基因主要在肌肉组织中特异性表达;雌雄异体间的表达,肌肉组织Myf5的表达雄鱼显著高于雌鱼(P<0.05)。试验三:MyoD基因仅在第1外显子中发现1处突变G250A。MyoD有3种基因型(AA、BB和AB)。体重、体高表型值以AB基因型的为最高,以BB基因型的为最低,且3种基因型所对应的表型值组间差异显著(P<0.05)。体长表型值在3种基因型中表现出AA>AB>BB的关系,且不同基因型对应的表型值组间差异显著(P<0.05)。MyoG基因仅在第1外显子中发现1处突变C213T突变。MyoG基因有3种带型命名为:CC、EE和EC。3种不同基因型对体重、体长和体高表型值的影响表现出EE基因型>EC基因型>CC基因型的变化关系,且EE基因型显著高于基因型EC和CC基因型(P<0.05)。