本文在对内陆水体遥感国内外研究现状以及面临的主要问题进行归纳总结的基础上，针对自然水体波浪水面反射光与光学浅水底部反射两大干扰因素以及内陆水体成份复杂、遥感反演精度不高等三方面内容进行了较系统的研究。主要研究内容包括： (1)针对水面反射光的强烈干扰，构建了一个数值波浪水面仿真模型与波浪水面太阳耀光模型，分析了太阳耀光模式(范围、中心与强度)的分布规律与影响因素，并据此提出了水面光谱测量避免太阳耀光的最佳观测几何。 (2)基于理论分析与实验验证基础上，系统地回答了自然水面基于偏振原理剥离波浪水面反射光的可行性。论证了基于偏振原理，在平静水面是可以完全剥离水面的镜面反射光；而在波浪水面不能直接完全剥离，但本文提出了校正偏振剥离残余反射光的方法，从而实现了基于偏振原理剥离波浪水面反射光的方法，从而可以直接有效地获取离水辐亮度。 (3)针对内陆水体光学特性复杂多变与水质遥感机理研究薄弱这一问题，通过Monte Carlo模拟探讨了内陆水体组分光谱之间的耦合效应，分析了小同水体组分对水面反射光谱的相互影响；探讨了内陆水体光场的垂直结构；提出光学浅水校正水底反射率的方法；基于Monte Carlo模拟实现典型内陆水体区域-太湖生物光学模型的参数化。 (3)基于对内陆水体叶绿素a反射率光谱的深入认识与遥感反射率光谱的影响因素分析，利用地面实测高光谱数据与EO-1/Hyperion数据，发展了波段最优化的半分析反演方法。 (4)基于太湖实测的固有光学量(吸收系数与后向散射系数)，结合MonteCarlo模拟得到的太湖生物光学模型参数，实现了TM数据的半分析方法叶绿素、悬浮物与黄色物质三要素的同时反演。 (5)针对水底对光学浅水水面光谱的显著影响，结合实测水深与透明度数据提出了光学深水与光学浅水的划分方法；基于二流近似的方法校正了水底反射率，实现了光学浅水的定量反演，为光学浅水的定量反演奠定了理论基础。