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本研究对四川省小麦条锈菌越夏区的49个菌株进行了毒性检测，并且利用AFLP分子标记对其进行了遗传多样性研究，主要结果如下：
1、49个菌株中共检测出10个生理小种类型，其中水—14和CY32为优势小种。通过聚类分析发现，小种检测结果与地理来源间相关性较低。
2、建立了适用于小麦条锈菌的AFLP反应体系。
3、从64对EcoRⅠ/MseⅠ引物组合中，筛选出多态性丰富的7对引物组合。在供试的49个菌株的基因组中，7对引物共扩增出带型整齐且清晰的168条带，其中多态性条带为32条，多态率为19．05％。
4、49个菌株的遗传相似系数为0．4063～0．9688。聚类结果表明：当遗传相似系数为0．730时，菌株可分为4组。除菌株28和49外，各菌株间存在较为相近的遗传关系。而对AFLP多态性标记所进行的主坐标分析结果与聚类的结果基本一致，而主坐标分析能更直观地反映出菌株间的遗传关系。两种结果—表明在四川省越夏区的不同地区间小麦条锈菌存在较近的亲缘关系。
5、49个菌株的毒性与DNA多态性进行相关性分析结果表明：两者间的相关系数为0．1817，两者之间存在较低的相关性。