海南黎族是中华民族大家庭中的一员,主要聚居在海南岛,黎族根据方言、生活习俗、文化特征及体质学上的差异分为五个支系:美孚黎、本地(润)黎、杞黎、侾黎、加茂黎。关于黎族各个支系的起源及相互之间的关系一直存在不同观点。我们选取了黎族3个支系群体:美孚黎(Meifu),本地(润)黎(Benti),杞黎(Qi)作为研究对象,采用荧光引物PCR毛细管电泳扫描分型和链式扩增产物酶切长度特异性(PCR-RFLP)法两种基因分型技术,对205例样本Y-DNA的10个Y-SNP位点:M175、M95、M119、M88、M110、M122、M134、M7、M117、M121进行基因分型,将所得单倍群分布频率与其他相关群体资料进行比较和主成分分析。结果黎族群体共检出5种单倍群,其中H9和H11所占比例很高,在三个支系中二者总和分别均超过了80%,特别是H11频率明显高于其他民族群体。主成分分析中三个支系聚合紧密。单倍群分布频率与主成分分析支持美孚黎,本地黎,杞黎三个支系有共同的父系起源,和百越族群关系密切。研究证实,海南黎族三个支系的祖先是从百越族群的先民中分化出来,而且分化年代比较久远,进而发展分支。本研究通过黎族三个支系Y染色体单核苷酸多态性(SNP)分析,阐明了黎族三个支系部分父系遗传结构,并通过结合相关资料,对黎族三个支系的基因源流进行初步探讨。黎族三个支系无疑都是百越后裔,具有共同的父系起源,北部湾沿海地区可能是孕育他们共同祖先的摇篮。研究为黎族三个支系的起源及相互间关系等问题提供了确实而直接的遗传学证据,是对基于语言学、考古学、人类体质学等黎族群体研究的有力补充,结果有助于黎族整个群体起源、迁徙、进化的研究。同时,研究中积累的黎族人群DNA信息也为疾病相关分析、流行病学等医学研究提供了一定的遗传背景资料。