生物技术正向纵深发展。在医药方面已经给人们带来可观的经济效益。在转基因植物方面也取得了令人瞩目的发展。在作物抗虫，抗病，抗除草剂及品质改良方面收到不少经济效益，农民现时相对受益。但是也发现一些不可忽视的问题。主要表现：一是对人体健康可能有一定的影响，如毒蛋白，草甘膦，病毒外壳蛋白，抗生素抗性等;二是可能对生态环境产生不利影响，例如，作物对杀虫剂的耐药性，毒性对生物及害虫种群变化的影响，植物对锄草剂的耐性，除草剂对土壤及水分，对生物环境生态平衡的影响;基因飘逸到其它近源物种;对野生物种多样性;嵌合载体成分对细菌及病毒的影响等。所发生的影响不只是初期发现的直接的或间接的不利作用，还可能有长期的潜在的不利影响，如对耕作制度，生物资源，商贸竞争的不利影响。转基因植物的安全问题还在不断增加。一些研究发现，某些转基因作物这些问题主要可产生于对目标基因及标记基因的选择上，以及构建的易于转移的基因运送载体和它所携带的各种调控元件上。应当承认，转基因植物不都是有问题的。但是，大部分人都承认，存在一定程度风险，应权衡利弊。科学愈辩愈明，技术愈改进愈安全。现在对转基因植物的安全性的问题应该引起高度重视。为减少和防止转基因产品的风险，第一，应早期避开产生风险的因素，研究革新转基因技术，开发或利用可替代的更安全的基因操作平台，生产更安全的基因工程产品，这是科学工作者的重要责任;第二，建立严格的基因工程生物的安全管理制度。增加检测内容，研究灵敏的检测技术，早期检测及预测技术，跟踪研究转基因体对人体健康，对农业生态环境的直接和间接影响，包括生态平衡及土壤，水分，空气的影响。早期避免对人体健康和生态环境造成潜在的威胁。这是管理部门的重要责任。