目的 通过比较肺腺癌不同TNM分期的手术组织标本的基因表达差异,筛选肺腺癌各TNM分期中的标志基因.方法 采用含25,100个人类功能基因的Oligo芯片,比较10例未经放、化疗的肺腺癌患者手术癌组织和癌旁组织标本的基因表达谱差异,筛选有2倍以上表达差异的基因；用筛选得到的差异表达基因,再使用SAM软件分析不同TNM分期(Ⅰ期3例、Ⅱ期3例和ⅢA期4例)的差异表达基因；使用GoMiner软件分析差异基因的功能；使用KEGG软件对差异基因进行通路分析.结果 比较了10例肺腺癌患者的癌组织和癌旁组织基因表达谱,筛选出有2倍以上差异表达的640个基因,其中289个基因在癌组织中上调表达,351个基因下调表达.通过对10例不同分期肺腺癌患者的癌组织基因表达谱比较分析,筛选出在不同分期中呈不同水平表达的16个差异基因.7个基因在Ⅰ期显著差异表达,1个基因在ⅢA期显著差异表达,4个基因在Ⅱ期显著差异表达,4个基因在Ⅱ期和ⅢA期均差异表达,首次发现MIF1IP、CENPN、CBFA2T2、ANKRD36B、GINS2、ZMIZ2、LDLR七个基因在肺腺癌中差异表达,相关功能检索和通路分析发现：2个基因与细胞间信号转导有关,3个基因与细胞生长代谢有关,4个基因为转录因子.结论 通过筛选肺腺癌不同TNM分期的差异表达基因,推测Ⅰ期肺腺癌显著差异表达基因有利于肺腺癌早期诊断,Ⅱ、ⅢA期显著差异表达基因可能与肺腺癌转移有关,是潜在的预后评估生物标记物和药物开发的新靶标.2002年最新统计数据表明,在全球范围内,不论发病率还是死亡率,肺癌均位居所有恶性肿瘤的第一位[1],其主要由非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)组成(占80％).我国肺癌发病率和死亡率一直呈上升趋势,自2000年起已跃居我国癌症首位[2].尽管手术切除后肺癌患者的治疗得到了提高(如辅助治疗),并针对转移采用了更有效的治疗策略(如分子靶向治疗),但是肺癌的治愈率仍然很低.发掘肺癌新的预后标志物、预测标志物或开发新的检测工具是当前研究的主要领域之一.然而,肺癌的发生是一个多因素过程且具有疾病遗传异质性的特点,仅仅检测一个或一些基因是不够的,全基因组分析将更有效的解释肺癌的复杂性[3].近年来,基因芯片技术以其高通量平行检测的优势使我们能从基因组范围内对组织细胞的基因表达谱进行研究,为研究肿瘤发生发展中多基因改变的分子机制提供了有力的工具.本研究旨在采用晶芯人类全基因组寡核苷酸芯片筛选出非小细胞肺癌Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期的差异表达基因,寻找这三期肺腺癌各期的标志基因,为临床的诊疗、预后评估、药物靶标提供新思路.