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目的：探讨长链非编码RNA (RERT-lncRNA)中一个四碱基插入缺失多态(rs10680577)与中国汉族人群肝细胞肝癌(HCC)易感性的关系及其具体分子机制.方法：(1)病例对照研究：采用病例对照研究设计,包括经组织病理学确诊的HCC患者1067例和按地区、性别及年龄频数匹配的对照人群1692名,以聚合酶链反应(PCR)方法进行基因分型,应用logistic回归计算OR值及95％CI值,比较不同基因型与HCC患病风险的关系.(2)基因型-表型研究：采用实时定量PCR和(或)Western blot方法检测72例HCC患者肝癌组织及5种常见肝癌细胞系中RERT-lncRNA和EGLN2表达量,分析rs10680577基因型与RERT-lncRNA及EGLN2表达量的关联性.Pearson相关方法分析RERT-lncRNA和EGLN2表达量的相关性.(3)功能验证及生物信息学分析：构建RERT-lncRNA-pcDNA3.1真核表达载体瞬时转染肝癌细胞系,验证RERT-lncRNA和EGLN2二者的调控关系.利用RNAfold和SNPfold软件预测rs10680577对RERT-lncRNA空间构象的影响.结果：回归分析显示,携带rs2279744位点缺失型等位基因能明显提高HCC的患病风险[OR (95％CI)值为：1.44 (1.26-1.64)],并且这种阳性关联在吸烟亚群中更为明显(Heterogeneity P=0.0007). 在HCC组织及细胞系中,rs10680577基因型与RERT-lncRNA及EGLN2表达量显著相关,携带缺失型等位基因样本的RERT-lncRNA及EGLN2表达量均显著高于插入型等位基因样本,并且RERT-lncRNA和EGLN2表达量呈显著性相关(R2=0.54,P＜0.001).体外过表达实验发现过表达RERT-lncRNA能显著提高EGLN2表达量.生物信息学预测结果显示rs10680577可以影响RERT-lncRNA空间构象.结论：本研究结果提示rs10680577有可能通过改变RERT-lncRNA的空间构象从而影响RERT-lncRNA的表达,进而实现对其下游基因EGLN2的调节,参与HCC的发生.rs10680577有望成为中国汉族人群中HCC早期诊断的潜在分子标志.