波罗的海希瓦氏菌TMAO还原酶基因簇的克隆和序列分析

来源 :中国食品科学技术学会第十一届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woxxlong
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  养殖鱼类在腐败进程中希瓦氏菌(Shewanella)能还原TMAO产生腥臭味的TMA,为分析希瓦氏菌的腐败机制,研究克隆和分析了冷藏大黄鱼特定腐败菌波罗的海希瓦氏菌(S.bahica)XH2氧化三甲胺(TMAO)还原酶基因簇序列.通过NCBI中相关序列,自行设计4对引物,PCR成功扩增出4015 bp、940bp、2634bp和2560bp特异性产物.将PCR产物克隆测序和拼接后,获得了9711bp的TMAO还原酶基因簇序列.生物信息学分析显示,该序列包括TMAO还原酶的操作子torECAD及调控系统torRTS的7个ORF,分别为TorE,TorC,TorA,TorD,TotS,TorT和TorR,其功能分别为硝酸盐还原酶、C型细胞色素、TMAO还原酶、伴侣蛋白、传感器、细菌周质蛋白、转录调节器.通过BLASTX比较发现,该序列与S.baltica OS185的TMAO还原酶基因簇有很高的相似性,分别为93%、99%、99%、99%、96%、97%和98%.研究为阐明S.bahica在水产品贮藏过程中TMA形成的分子腐败机制提供支持.
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