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应用FQ-PCR对肠炎沙门氏菌感染后30min、1h、2h、4h、8h、12h、24h、36h、48h、72h 、6和9天呼吸道内肠球菌进行检测。正常对照组鸭呼吸道内肠球菌属菌群总体上呈波动变化，在 8h达到峰值；皮下攻毒组呈下降趋势，30min时肠球菌属菌群含量最多；口服组前期呈下降趋势，后期轻微的波动，48h达到峰值；滴鼻组总体呈波动变化，在48h时出现最低值。表明肠球菌的变化情况与感染途径密切相关，肠炎沙门氏菌感染鸭的途径与其致病力密切相关，结果对解释人和家禽SE感染的致病机理具有重要作用。