【摘 要】
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使用Discovery Studio4.5虚拟筛选平台,结合分子对接及Hypogen药效团筛选的方法.对可能的新德里β内酰胺酶1(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1)抑制剂进行筛选.以期获得作用于NDM-1的新结构类型抑制剂.结果表明成功建立了基于3D-QSAR的NDM-1抑制剂药效团筛选模型,并通过结合LigandFit分子对接、两种评分函数(-PMF,
【机 构】
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北京协和医学院&中国医学科学院医药生物技术研究所,北京 100050
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使用Discovery Studio4.5虚拟筛选平台,结合分子对接及Hypogen药效团筛选的方法.对可能的新德里β内酰胺酶1(New Delhi metallo-β-lactamase-1,NDM-1)抑制剂进行筛选.以期获得作用于NDM-1的新结构类型抑制剂.结果表明成功建立了基于3D-QSAR的NDM-1抑制剂药效团筛选模型,并通过结合LigandFit分子对接、两种评分函数(-PMF, Dock Score)、Linpiski类药五原则及Veber规则,对Drugbank等数据库的化合物进行筛选,并使用Analyze Ligand Poses进行阳性化合物确证。最终获得90个阳性化合物进行下一步的酶学水平验证。
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