目的：呼吸道合胞病毒(RSV)是导致婴幼儿呼吸道感染重要的病毒病原体,F蛋白为RSV疫苗及药物研究的主要蛋白,研究F蛋白遗传变异性为开发RSV疫苗奠定基础,目前中国地区尚无F蛋白基因分子流行病学系统研究报告.本研究分析中国重庆地区住院患儿RSV临床分离株F蛋白遗传变异性,为进一步研发RSV疫苗提供理论依据.方法：收集呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物(NPA)进行RSV病毒分离,挑选病毒分离阳性的标本进行核酸提取、逆转录,用特异性引物扩增F基因全长并测序,测序结果进行遗传变异分析.结果：2009年6月-2012年3月,对共1800份呼吸道感染患儿的NPA进行病毒分离,333 (18.5％)份为RSV阳性,其中277株(83.2％)为A亚型, 55株(16.5％)为B亚型,1株(0.3％)检测同时为A、B亚型阳性.随机挑选130份RSV病毒株进行测序(A亚型：107,B亚型：23).在碱基水平,A、B亚型的P-distance分别为0.050和0.024.通过比对,在氨基酸位点16,25, 45,102,122,124,209和447有显著的变异.在HLA相关的CTL识别表位,A、B亚型同时存在变异.在A亚型中,帕利珠单抗结合位点276存在N→S变异,其比例有逐渐增多占主导地位趋势.结论：RSV F蛋白高度保守的同时也存在变异,对F蛋白遗传变异持续监测、分析将有利于RSV疫苗及药物的开发.