道家思想对《内经》理论体系的建构存在客观而深刻的影响。《内经》在阐述其医道的过程中，呈现出极富老庄哲学思想的思维观念，无疑极大地丰富了中国传统医学哲学的内涵。在认识论方面，辩证思维的运用和发展，使《内经》在研究人体生理、病理和疾病诊治过程中，主观认识符合于生命运动的客观辩证过程，成为《内经》和中医学千年不朽和至今仍活跃于临床的根本原因；也由于历史条件和技术水平的局限性，朴素的辩证思维建立在直观基础上，未深入生命体内部微观细节，使其结论长于宏观、模糊而精准度方面很难深入。在方法论方面，有助于《内经》运用整体有机联系的系统方法，从功能角度，整体认识事物，具有模糊性、领悟性和形象思维的某些特点。因此，道家思想对《内经》理论体系的巨大影响值得我们从多角度、深层次进行研究和发掘。