以《中国企业自主创新能力分析报告》为依据,选取23个具有代表性的具体指标,构建企业创新能力评价指标体系.基于此,运用模糊层次综合评价法对中国西部地区的企业创新能力进行评价和排序,聚类分析方法将企业创新能力按相似性分为三类.研究结果表明,模糊综合评价排序与聚类分析结果相一致,西部各地区的企业创新能力发展不均衡,存在很大的差异,且每个类别的地区创新能力也存在差异,需提供相关政策建议,进一步提高西部地区的企业创新能力.新疆需要改善技术创新环境，制定相应政策鼓励企业进行创新活动，加大对R&D经费、人员的投资力度，降低对企业专利保护的税收，鼓励企业对公司的专利申请保护，以保障企业的知识产权。此外，人才是创新的主体，要注重培养人才，通过研发实战提高科研队伍的创新能力;加大企业对人才的奖励机制，定期组织员工在外培训等开阔视野，学习先进技术等，最大限度地提高企业员工的创新能力，进而促进新疆企业创新能力不断提高。