增生性瘢痕与正常皮肤组织差异表达基因的筛选与生物信息学分析

来源 :2014感染伤口的防治与修复研讨会、中国金属学会冶金安全与健康分会烧伤外 科学专业委员会年会、华北地区烧伤与整形外科学术 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xhb876
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的 比较人增生性瘢痕与正常皮肤组织中mRNA表达谱的差异,并对差异基因行生物信息分析,从分子水平全面探讨增生性瘢痕的发病机制,为临床治疗提供新靶点.方法:收集我院手术切除的增生性瘢痕及其邻近正常皮肤组织,采用Trizol试剂提取总RNA,进行mRNA芯片检测,利用Genespring 10.0软件筛选表达差异基因,并对增生性瘢痕和正常皮肤组间组内行聚类分析,应用DAVID Bioinformatics Resources6.7对差异基因进行基因本体(GO)、生物学通路(Pathway)分析,获得差异基因相关功能的功能富集类.结果:人增生性瘢痕与正常皮肤组织相比较,mRNA相对表达量比值在2倍以上变化的共6126条,2倍以上上调的共3142条,2倍以上下调的共2984条,5倍以上上调的共28条,5倍以上下调的共44条.CDKN1C,CDKN2A, CTNNA3,COL6A3,HOXB4等差异表达基因与细胞周期、细胞增殖、以及细胞粘附等生物学过程密切相关,TGFB1,CDKN1C,CDKN2A,CDC14A,ITGB6,EGF等差异表达基因主要参与黏着斑形成、β转化因子(TGF-β)信号通路、细胞周期信号通路、P53信号通路、肿瘤相关信号通路.结论:人增生性瘢痕与正常皮肤组织比较,mRNA表达谱发生了明显变化,TGFB1,SMAD2,SMAD7,BAX,IGF, COL1A1,COL1 A2,MMPs,CDC 14A,ITGB6,EGF, CDKN 1C,CDKN2A,CTNNA3,HOXA3等相关基因参与的生物过程、分子功能、信号通路可能与增生性瘢痕的发生发展密切相关.
其他文献
45年前,当他把相机镜头对准西北大漠那个叫罗布泊的地方,对准那些为共和国国防科技事业奉献青春和热血的部队官兵时,他没有想到,同为拓荒者的他用两万多张珍贵的照片记录下
  目的 观察miR-203与P63在人表皮干细胞和角质形成细胞中的表达变化,探讨其在表皮增殖分化中的作用及意义.方法:(1)采用酶消化和Ⅳ型胶原快速贴壁相结合方法获得人表皮干细
会议
引言自从上次国际光纤和通信指南出版一年以来,取得了很多令人鼓舞的进展,对光纤市场,光纤技术继续革命的影响巨大。本文旨在评述有关近年的一些实质性问题。甚至在本光纤指
  目的 长链非编码RNA(lncRNA)曾被认为是基因组转录的"噪音",是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,不具有生物学功能.但近期众多研究表明,lncRNA以RNA的形式调控蛋白编码基因在多种
会议
日本办公场所卫生标准规则胡焕秀译第一章总则第一条适用范围1.本省今主要适用于在办公场所从事办公工作(包括使用穿孔机、打字机等其他办公机械和主要使用这些机械)的工作人员。
  目的 探讨糖尿病大鼠与正常大鼠皮肤创面组织的microRNAs (miRNAs)差异表达谱及其意义。方法:链脲佐菌素一次性腹腔注射法建立糖尿病大鼠模型;四周后,取糖尿病成模大鼠及正
会议
从体表获取胃电信号.具有无创伤、无痛苦和不影响受测对象的正常生理状态等的一系列优点,故极有可能成为消化道生理研究、医疗诊断和药理实验的有效手段之一,因而引起了人们
不论是研究数学教材、数学教学,还是数学学习,都要善于透过现象抓住数学知识本质.在“乘法分配律”的教学中,运用联系的观点和思维,借助数与形、知识的关联与迁移,去发现、表
身体素质与交通事故刘家毅交通事故是和平时期成胁人类生命最广泛、最常见、最严重的一种祸害.针对这一严重的社会问题,许多学科都从道路、车辆、环境、驾驶员的心理等方面,对产
“面积的变化”是苏教版教材“分数四则混合运算”中的“动手做”的内容.学生从解决面积变化的问题开始,经历了质疑、释疑、寻理的探究规律的过程,用数形结合的思想有效构建