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本研究以陆地棉标准系“TM-1”和具有陆地棉三元杂种血缘的“渝棉1号”配制F1杂交组合，以TM-1为轮回亲本组配BC1，连续回交4代获得BC4，自交后得到包含156单株的高代回交自交群体BC4F2及其衍生BC4F2:3和BC4F2:4的研究材料(Popl)。通过3980对SSR引物、238对SRAP引物组合引物和85对TRAP引物组合引物对亲本进行标记多态性筛选，共获得228对多态性引物，多态性比例为5.29％.119个多态性标记位点定位到26个连锁群上，标记间平均遗传距离为5.50cM,连锁图谱覆盖654.1cM，约占棉花基因组的14.70%.A亚组染色体覆盖长度较D亚组长，但差异不明显;亚组间标记平均距离有明显差异，58%的标记归属于A亚组,36%的标记归属于D亚组。所得连锁群定位到14条染色体和3条未知连锁群上。通过复合区间作图法(CIM)对Popl群体纤维品质性状进行QTL、定位分析，将控制5个纤维品质性状(纤维长度、断裂比强度、马克隆值、伸长率和长度整齐度指数)的23个QTL.(包括7个与纤维长度相关，1个与长度整齐度指数相关，4个与马克隆值相关，5个与纤维断裂比强度相关，6个与伸长率相关)定位于5条染色体上，分别为Chr.5、Chr.13、Chr.15、Chr.19、Chr.24，且均只在单环境下被检测到，贡献率为14.O1%-36.66%。增效基因多来自于TM-1，个别来自于渝棉1号，表明群体各性状已趋向纯合，多为轮回亲本TM-1基因型，个别性状由渝棉1号的渐渗片段控制。依据Popl QTL定位结果，利用QTL、所属染色体区段紧密连锁的标记对巨[(TM-1×Acala SJ)×TM-1]BC4F2群体(Pop2)进行多态性分析，获得4对多态性引物并产生4个标记位点。通过连锁分析将3个标记位点定位于Chr.24上，并对Pop2的纤维品质性状各指标进行QTL分析，共获得3个与纤维品质相关的QTL(1个与马克隆值相关、1个与长度整齐度指数相关、1个与断裂比强度相关)，得到1个断裂比强度相关的QTL(qFS10BD)与Popl(qFSllQX)中具有相同的标记区间(NAU5379-NAU1125)，贡献率为20.14%，且增效基因均来源于渝棉1号，表明c24上与断裂比强度相关的QTL可能是一个主效QTL。