随着当前经济社会体制改革的不断深化，不少事业单位的党建工作却依旧是基层党建工作中较为薄弱的环节。表现在以下方面：
　　1.党建工作活力不强。首先是对党建工作的认识不够端正，对党建工作的重要性认识不够透彻。因此导致了在开展党建工作时消极怠工、积极性不强、行动力不足，使得党建工作漏洞较多。其次，事业单位中的党建工作存在责任模糊的问题。一是对党建工作的划分不够明确，相关人员存在承担任务不均的问题；二是没有完善的监督机制，对于工作是否及时完成、完成质量如何缺乏有效的监管，导致管理混乱。第三，党建工作脱离实际。部分单位在开展党建工作时，不考虑单位的实际情况，盲目而不计后果，导致党建工作效果不理想，甚至与主管单位脱节。第四，党组织生活不够丰富。由于相关人员缺乏积极性和系统的组织管理，使得党组织活动形式单一、吸引力差，甚至淪为面子工程，不利于党组织内部的交流和发展，当然也无法促进党建工作效率的提升。此外，部分事业单位的党组织工作方式没有与时俱进，工作方法较为落后，不利于党建工作的顺利开展。
　　2.党员主体意识不强。党员主体意识不强也是目前事业单位存在的一个较为严重的问题。一是部分党员党性不强，党员意识淡薄。部分党员在入党之后积极性有所降低，对自己的要求也在降低；更甚者无视党纪国法。二是在模范带头作用方面做得不够充分。部分党员在工作中不上进、不积极、缺乏思考，只为完成工作，而不追求工作的质量。三是部分党员明哲保身的行为较为严重。部分党员为了自身利益，面对干部的违纪行为不敢举报、不敢批评，害怕引火上身，没有原则。这使得党组织的风气日益变差，不利于互相监督和清廉行政的推行。