2012年6月某日，陕西省某县一名12岁女孩W被害，警方在犯罪嫌疑人张A家凉席背面发现了巴掌大一块红色可疑斑迹，提取后经DNA检验和同一认定比对，该斑迹为残留的人血和精液的混合物，其中人血DNA数据与受害女孩血样一致，精斑DNA和张A血样一致。张A也对作案事实供认不讳。但是，警方发现张A还有一个双胞胎弟弟张B，这兄弟俩的DNA检测结果完全一致，是拿着重号的生物学身份证的单卵双胞胎。虽然还有多项证据证实是张A作案，但为了慎重起见，警方还是将检材以及受害女孩、张A、张B的血样送到某军医大学司法鉴定所进行再次检验。
　　功夫不负有心人，鉴定所应用多种生物学检测方法进行检验，最终在张B的DNA中发现了一个十分罕见的基因变异，而这个变异在张A的DNA中以及检材精斑的DNA中均不存在。据此排除了张B的作案嫌疑，确认张A为该案疑犯。这个案例也说明了，为什么所有的DNA检验报告只用“似然比率”来描述检验结果，而从来不用绝对化的词语做出某种肯定的结论。
　　样本比对是
　　关键
　　如前所述，将DNA个体识别功能应用到侦查办案中去，常能发挥无可替代的巨大作用。但在现实破案过程中，DNA个体识别功能也受到一定的局限，就是需要进行检材和样本一对一的比对。比如我们在A案现场，检出犯罪嫌疑人的DNA数据为“13579”，将该数据输入DNA数据库中，检索出“杨过”的DNA数据也是“13579”，警方就可以确认“杨过”为A案的犯罪嫌疑人了。但是，如果在数据库中，尚未收集到“杨过”的DNA数据，那就查不到“杨过”身上了。然而，这次没查到，并不等于以后不会查到。我们把这次检出的DNA“13579”录进数据库中，如果十年后“杨过”因打架斗殴被警方采集了DNA数据，经过比对，就能确认“杨过”是十年前A案的犯罪嫌疑人了。
　　再如，我国公安机关近年来侦办的许多拐卖儿童的案件，将被拐卖儿童的DNA与正在寻亲的若干父母的DNA进行比对，使许多离散多年的家庭得以团圆。然而，公安部打拐办的网站上仍然挂着许多被拐卖儿童的照片，这些儿童的DNA数据也都被采集了，但为什么就是找不到他们的亲生父母呢？就是因为公安机关没有采集到这些被拐卖儿童亲生父母的DNA数据，无从进行比对。
　　mtDNA、yDNA
　　为破案提供新思路
　　随着科学的不断发展，生物学家在探索研究中又发现了DNA的另外一些特征。研究表明，父母在给子女复制生物身份证时，也不是完全无私地把双方的基因混在一起自由组合。比如，mtDNA就是由母亲单独原样遗传（母系遗传），yDNA则是由父亲单独原样遗传（父系遗传）。所以，在不发生基因突变的前提下，一个人的mtDNA与他的母系血亲完全一样，yDNA则与他的父系血亲完全一样。
　　由于mtDNA、yDNA分别由母系和父系独自遗传所得，所以这个生物身份证的编码就不是一个人所独占，而是由与母系或父系血缘相关的人所共有。就像居民身份证上的前6位编码一样，输到电脑上一比对，就能检索出你是何省、何地、何县人。于是，当我们把犯罪现场提取的mtDNA或yDNA数据在电脑上检索，只要数据库中有相同的mtDNA或yDNA数据，两者即为比对成功。但是，比对出来的这个人不一定就是犯罪嫌疑人，警方需要在与比对出来的这个人有血亲关系的人中进行排查，同时对这个群体中的可疑人员提取血样进行DNA检验，就完全有可能再用个体识别方法查到真正的犯罪嫌疑人了。2016年8月26日，白银、包头连环强奸杀人案被侦破，就是通过yDNA的检验，比对出了该基因出自于当地一个高姓父系群体，警方在该高姓群体中进行深入调查，并提取若干嫌疑人的血样进行DNA检验，最终锁定并抓获了犯罪嫌疑人高某。