【摘 要】
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为快速确诊内蒙古阿尔山地区突发的一起饲养野猪疫情,完成未知病原的检测与鉴定,从而迅速阻击疫情,本研究采用纳米孔(Nanopore)快速测序方法,在接到样品后150 min内检测出213
【机 构】
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福建农林大学动物科学学院蜂学学院,军事医学研究院军事兽医研究所
【基金项目】
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畜禽重要疫病的微生物组及新发病毒的病原生态学研究(2017YFD0500104)
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为快速确诊内蒙古阿尔山地区突发的一起饲养野猪疫情,完成未知病原的检测与鉴定,从而迅速阻击疫情,本研究采用纳米孔(Nanopore)快速测序方法,在接到样品后150 min内检测出213条非洲猪瘟病毒(ASFV)序列,覆盖28.1%全基因组序列,迅速锁定该野猪疫情是由ASFV导致。为验证快速检测的准确性和可靠性,本研究进一步使用连接测序方案对该样品进行高通量测序,共获得9.0 G数据,包含1826条ASFV序列,拼接出99%的全基因组,测序深度为5.02×,进一步确认该疫情是ASFV引起。本研究通
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