【摘 要】
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目的 分析安徽省肥东县候鸟监测站1只死亡天鹅中的H5N8亚型禽流感病毒(AIVs))的遗传进化特征。方法 从收集的死亡天鹅样本中提取病毒RNA,使用实时荧光定量RT-PCR区分流感亚型,并采用一代测序方法对阳性样本的HA和NA基因扩增后测序,应用生物信息学软件构建系统发育进化树并分析其分子特征。结果 2020年12月1日收到来自安徽省肥东县1只死亡天鹅的鼻拭子、鸟喙拭子和泄殖腔拭子样本,PCR结果
【基金项目】
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安徽省卫生健康委科研重点项目(No.AHWJ2021a030);
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目的 分析安徽省肥东县候鸟监测站1只死亡天鹅中的H5N8亚型禽流感病毒(AIVs))的遗传进化特征。方法 从收集的死亡天鹅样本中提取病毒RNA,使用实时荧光定量RT-PCR区分流感亚型,并采用一代测序方法对阳性样本的HA和NA基因扩增后测序,应用生物信息学软件构建系统发育进化树并分析其分子特征。结果 2020年12月1日收到来自安徽省肥东县1只死亡天鹅的鼻拭子、鸟喙拭子和泄殖腔拭子样本,PCR结果均显示H5阳性,测序结果提示3份样本为同一株H5N8亚型禽流感病毒。遗传进化分析显示,该病毒属于2.3.4.4支系且与埃及、俄罗斯等地分离株有很高的相似性,其HA与NA基因都在欧亚谱系中,并且已经适应了不同宿主。该病毒HA裂解位点呈现高致病性分子特征,存在6个糖基化位点,且发生S133L、S137A、T160A、D187N、K193N、Q196K、S227R氨基酸突变。PB2蛋白发生K389R、V589T突变、PA蛋白发生N409S突变、M1蛋白发生N30D、T215A突变、NS1蛋白发生P42S突变。结论 本次发现的H5N8亚型禽流感病毒受体结合位点仍为禽源受体,但具有人源受体分子特征,其他氨基酸位点都提示该病毒有毒力增强的危险性,需进一步加强监测。
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