目的：建立稳定可靠的SRAP分子标记反应体系,为进一步研究薏苡种质资源的分子鉴定提供依据。方法：采用改进的SDS法提取薏苡种子胚基因组DNA,并采用单因素试验分析Mg2+浓度、dNTP浓度、BSA浓度、模板DNA用量、引物浓度、Taq DNA聚合酶用量等6个因素对薏苡相关序列扩增多态性(SRAP)扩增结果的影响。结果：建立了薏苡最适的SRAP反应体系;10μL PCR反应体系中,含1×Taq酶配套缓冲液(10 mmol/LTris·HCl,pH9.0,50 mmol/L KCl,0.1％Triton X-100),1.5mmol/L Mg2+,0.15 mmol/L dNTP,10 ng模板DNA,10 pmol引物,0.5 U Taq酶。结论：所建立的薏苡SRAP反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定等特点,为薏苡种质资源的分子鉴定提供了良好的基础。