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湖盆古水深的恢复是古湖盆的重要研究内容，对恢复湖盆古水深的沉积学方法、地球化学方法（Th／U比值法）、古生物方法及定性的相对古水深曲线方法等进行了阐述。目前古水深研究多以定性为主，运用古生物资料根据古生物分异度与水深的关系定量恢复古水深，以及根据沉积微相的横向和纵向的相序关系来计算古水深是今后研究的重点。