目的 探讨甲状旁腺腺瘤（PA）中关键lncRNA在PA与甲状旁腺癌（PC）鉴别诊断中的价值。方法 选择2017-01-01-2021-02-28在北京世纪坛医院手术治疗的原发性甲状旁腺功能亢进症患者57例，其中PA 46例，PC 11例。在PA中构建差异lncRNA与mRNA的共表达网络，在该网络中选择与之有关的mRNA数目最多的关键lncRNA,且满足芯片中均一化信号值>7的lnc-RAPGEF2-3:1。通过实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）试验验证PA及PC标本中lnc-RAPGEF2-3:1的表达，分析lnc-RAPGEF2-3:1与患者临床特征的相关性，并使用受试者工作特征（ROC）曲线评估其在PA与PC鉴别诊断中的价值。结果 在PA组中构建共表达网络，与lnc-RAPGEF2-3:1存在相关性的mRNA最多（共9条）,其中双功能凋亡调节因子（rs=0.982,P<0.001）及脂肪酸结合蛋白5（rs=0.996,P<0.001）与lnc-RAPGEF2-3:1呈正相关，寡核苷酸结合摺叠区1基因（rs=-0.997,P<0.001）和抗肌萎缩蛋白（rs=-0.997,P<0.001）与其呈负相关。PC组与PA组lnc-RAPGEF2-3:1的表达分别为-4.470（-6.270,-0.090）和-5.885（-6.645,-5.317）,差异有统计学意义，Z=-2.022,P=0.043。lnc-RAPGEF2-3:1在PA组中与甲状旁腺素（PTH）、血钙及肿瘤大小均无关联，是PA的保护因素（OR=0.485,95%CI:0.273～0.859,P=0.013）。在PA与PC的鉴别诊断中，lnc-RAPGEF2-3:1联合临床指标（血钙、PTH及肿瘤大小）的ROC曲线下面积达0.800（95%CI:0.673～0.895,P<0.001）,与本课题组前期关注的“lncRNA score”差异无统计学意义，Z=1.008,P=0.314。结论 lnc-RAPGEF2-3:1可能是PA患者的lncRNA-mRNA共表达网络中重要的调控点，与临床指标联合后可能为PA与PC的鉴别诊断提供新的方法。