目的:公立医院在我国医疗服务机构中占居主体地位,研究公立医院临床科室运行效率具有代表性,对提高整个医疗服务机构的效率有可参考性.从近年来步入深水区的医疗体制改革看,公立医院的经营管理受到巨大影响,各种调研分析、实证结果都表明,公立医院亟需改进现有临床管理模式,提升运行效率,化解成本高居不下、资源利用不充分等难题.本文以北京市某三级公立医院临床科室运行情况为例,借助数据包络分析法,深入剖析,提出解决问题对策.方法:数据包络分析法简称DEA,是分析和解决组织效率、资源利用率问题的有效方法.公立医院通过合理设计DEA模型,分析评价医院投入产出效率,为医院经营管理提供决策依据.结果:本次样本集合包括37个临床科室,其中23个科室相对综合效率达到1,投入产出匹配度良好;14个科室相对综合效率不足,存在不同程度的投入产出冗余情况,资源利用率不足.结论:公立医院应借助信息网络化技术,结合所处位置、医院专长,科学规划、合理调配,重点改进相对效率不足科室医疗资源投入产出水平,促进公立医院整体运行效率提升,达到经营效益和管理效益的双高.