RT-PCR中加工过的假基因的干扰及解决办法

来源 :中华医学遗传学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cser905
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目的发现和克服RT-PCR中可能存在的假基因的干扰。方法采用RT-PCR法扩增人肺鳞癌标本中角蛋白19(CK19cDNA或DNA序列。结果通过设立分别以基因组DNA和未经逆转录的RNA为模板的对照可观察到CK19假基因的干扰现象。用脱氧核糖核酸酶预处理RNA标本或在设计错配引物的基础上选择合适的退火温度可消除干扰。结论在运用RT-PCR法分析哺乳动物基因表达时常存在假基因的干扰,以上方法可有效地发现和克服这种干扰作用 Objective To discover and overcome the interference of possible pseudogenes in RT-PCR. Methods The cytokeratin 19 (CK19 cDNA or DNA sequence) was amplified by RT-PCR from human lung squamous cell carcinoma specimens.Results The interference of CK19 pseudogene was observed by setting up the control with genomic DNA and reverse transcriptase RNA as template RNA interference with deoxyribonuclease pretreatment of RNA samples or design of mismatch primers based on the selection of the appropriate annealing temperature can be eliminated.Conclusion The use of RT-PCR analysis of mammalian gene expression often exist pseudogenes interference, the above method can Effectively detect and overcome this interference
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