【摘 要】
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运用生物信息学方法,从丹参(Salvia miltiorrhiza)基因组数据库中鉴定得到5个脱氢抗坏血酸还原酶(Dehydroascorbate reductase,DHAR)家族成员SmDHAR1 ～SmDHAR5,分析了基因结构
【机 构】
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陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心,陕西省西安植物园,陕西省植物研究所,西安710061;陕西学前师范学院生命科学与食品工程学院,西安710100
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运用生物信息学方法,从丹参(Salvia miltiorrhiza)基因组数据库中鉴定得到5个脱氢抗坏血酸还原酶(Dehydroascorbate reductase,DHAR)家族成员SmDHAR1 ～SmDHAR5,分析了基因结构特征、编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、高级结构、系统进化关系以及启动子顺式作用元件,并考察了其在不同组织及胁迫下的表达模式.结果表明,SmDHAR基因家族成员长度在724 ～3296bp之间,含有1～5个外显子不等,编码218～470个氨基酸;其编码蛋白多为亲水性蛋白,且多不含跨膜结构域.SmDHAR家族成员分布在叶绿体和胞质外.系统进化分析结果显示丹参SmDHAR基因分为2个亚类.上游启动子区域分析发现SmDHAR基因家族成员均含有与植物发育、激素及胁迫响应相关的顺式作用元件.表达模式分析结果显示,SmDHAR5在丹参根中显著高表达,而在其余组织中表达量较低;SmDHAR1、SmDHAR3与SmDHAR4在根、茎、叶中表达量较高,在花组织中表达最低;SmDHAR2表现为组成型高表达.SmDHAR在茉莉酸甲酯、酵母提取物、脱落酸、赤霉素、水杨酸等处理时也表现出不同的响应模式.本研究的结果为深入探索丹参DHAR基因家族在抵抗逆境过程中的功能提供了参考.
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