【摘 要】
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目的:研究强直性脊柱炎(AS)差异基因的免疫浸润情况,为深入了解AS的免疫相关机制提供理论依据。方法:运用R语言及相关安装包程序对AS差异基因进行基因本体论(GO)及基因通路富集分析(KEGG);通过CIBERSORT反卷积算法对22类免疫细胞在AS中的含量及比例进行分析;通过Coremine Medical及本草组鉴数据库对显著富集的免疫相关的生物学过程及核心靶基因进行中药预测。结果:AS相关的
【基金项目】
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湖南省研究生科研创新项目(CX20210683);
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目的:研究强直性脊柱炎(AS)差异基因的免疫浸润情况,为深入了解AS的免疫相关机制提供理论依据。方法:运用R语言及相关安装包程序对AS差异基因进行基因本体论(GO)及基因通路富集分析(KEGG);通过CIBERSORT反卷积算法对22类免疫细胞在AS中的含量及比例进行分析;通过Coremine Medical及本草组鉴数据库对显著富集的免疫相关的生物学过程及核心靶基因进行中药预测。结果:AS相关的蛋白网络互作枢纽靶基因涉及SNRPG、LSM3、PSMA6、MRPL22、RPL26、COX7C、PSMA4、RPS17、RPL31、SLIRP、NDUFS5、RPS24、NDUFB3、SRP14等14个靶基因,涉及中性粒细胞脱粒、T细胞介导免疫反应等多种途径,与NF-κB转录调控、核糖体生物发生、氧化磷酸化通路密切相关。CIBERSORT反卷积算法对AS的免疫相关性分析中,CD4+T细胞与γδT细胞呈中度正相关,CD8+T细胞与中性粒细胞呈中度负相关。AS组患者血清中单核细胞明显多于正常组,而正常组调节性T细胞明显少于AS组,其中SNRPG、LSM3、PSMA6、MRPL22与单核细胞、调节性T细胞呈负相关,但相关性较弱。雷公藤、蜈蚣、冬虫夏草与AS相关免疫浸润的关系最密切,涉及补肾活血汤、化痰逐瘀散结汤、寄生汤等多种方剂,功效多与清热补虚、补肾健脾、活血通络相关。结论:中性粒细胞、单核细胞、调节性T细胞与AS关系密切,并且CD4+T细胞与γδT细胞具有协同作用,筛选出的雷公藤、蜈蚣、冬虫夏草等中药可能作为其潜在的分子药物来源。
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