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目的 研究结核分枝杆菌(MTB)耐药基因芯片直接检测结核病患者临床标本中利福平和异烟肼耐药相关基因的临床价值.方法 回顾性分析125例通过硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)鉴别培养为MTB的临床标本,其中痰标本90例、支气管灌洗液12例、脓液12例、胸腔积液6例、组织标本3例、腹腔积液和尿液标本各1例,应用绝对浓度法同时进行利福平(RFP)和异烟肼(INH)药物敏感性试验(简称“绝对浓度法药敏试验”),并用基因芯片直接检测临床标本中MTB rpoB、katG和inhA基因型.以绝对浓度法药敏试验为标准,评价基因芯片检测RFP、INH耐药和耐多药(MDR)的敏感度和特异度,并且比较两种检测结果的一致性.结果 在125例结核病患者临床标本中,绝对浓度法药敏试验显示对RFP、INH的耐药率和MDR发生率分别为20.0％(25/125)[其中高耐占88.0％(22/25)、低耐占12.0％(3/25)]、17.6％(22/125)[其中高耐占18.2％(4/22)、低耐占81.80％(18/22)]、16.8％(21/125).初治和复治结核病患者临床标本中MDR-MTB的检出率分别为7.6％ (7/92)和39.4％(13/33).以绝对浓度法药敏试验为标准,应用基因芯片直接检测临床标本中MTB rpoB、katG和inhA基因型,预示对RFP、INH耐药和MDR的敏感度分别为72.0％ (18/25)、63.6％(14/22)和61.9％(13/21),特异度分别为91.0％(91/100)、86.4％(89/103)和89.4％(93/104),两种方法的一致率分别为87.2％(109/125)、82.4％(103/125)和84.8％(106/125).结论 应用耐药基因芯片直接检测结核病患者临床标本中MTB对RFP和INH耐药的相关基因突变具有中等的敏感度和较高的特异度,可快速检出对RFP、INH耐药和MDR-TB患者,为临床早期开展有效化疗提供实验依据.