【摘 要】
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盐胁迫是制约水稻产量的主要逆境因素之一,特别是对幼穗分化期的水稻产量影响尤其显著。本研究以水稻Affymetrix表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘,研究
【机 构】
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云南省农业科学院粮食作物研究所,云南省农业科学院农业经济与信息研究所
【基金项目】
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云南省应用基础研究青年项目(2017FD015),云南省技术创新人才培养计划(2015HB107)共同资助
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盐胁迫是制约水稻产量的主要逆境因素之一,特别是对幼穗分化期的水稻产量影响尤其显著。本研究以水稻Affymetrix表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘,研究幼穗分化期籼稻耐盐品种FL478和感盐品种IR29在盐胁迫处理条件下的基因差异表达情况。芯片数据分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因257个,以IR29为参照,FL478中上调基因138个,下调基因119个,主要涉及到β-丙氨酸生物合成、木糖降解、脂肪酸β氧化等生物学过程。通过这些数据挖掘,初步探讨籼稻抗盐胁迫的表达调控机理。本研究为
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