海洋沉积物氨氧化菌群落结构的测序分析

来源 :海洋科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：sophiechenq

【摘要】

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本文以氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria,AOB)特征基因氨单加氧酶(ammonia monooxygenase,AMO)α亚基基因(amoA)为目标基因(~491bp),分别采用克隆文库、454高通量测序

【作者】

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贺惠陈阳阳王勋功甄毓米铁柱于志刚李迎

【机构】

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中国海洋大学海洋生命学院,青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,海洋环境与生态教育部重点实验室,中国海洋大学环境科学与工程学院,海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室

【出处】

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海洋科学

【发表日期】

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2018年8期

【关键词】

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氨氧化细菌 454高通量测序技术 illumina测序技术克隆文库沉积物 ammonia-oxidizing bacteria pyrosequencing

【基金项目】

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国家自然科学基金项目(41521064, 41620104001),中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室、青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学开放课题(KLMEES201601).

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本文以氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria,AOB)特征基因氨单加氧酶(ammonia monooxygenase,AMO)α亚基基因(amoA)为目标基因(~491bp),分别采用克隆文库、454高通量测序和illumina测序技术对其群落结构进行了比较研究。结果表明,454高通量测序和illumina测序技术得到的菌群多样性及丰富度均高于克隆文库技术。在菌群组成方面,虽然3种测序技术检测到的优势类群均为亚硝化螺菌,但在菌群丰度方面存在差异。3种测序技术中,克隆文库技术在很大

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