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针对PCR仪嵌入式系统数据存储的特点，提出用USB设备作为接口的方案。详细讨论以M30627FJPGP为控制器，以CH375电路为USB设备接口的硬件系统设计，并给出系统的软件设计方案。给出USB在PCR仪嵌入式系统应用中遇到的难点和解决方案。实际应用证明，USB系统嵌入到PCR仪中方便了用户的操作，提高了PCR仪的工作效率和仪器的可用性。