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采用改进的SDS方法，从牡丹成熟叶片中提取基因组DNA，所得DNA样品的A260／A280值在1．7～1．8之间，琼脂糖凝胶电泳主带清晰、DNA纯度高、较少降解、不舍酶反应抑制剂，可被MseⅠ和PstⅠ两种限制性内切酶完全酶切．通过酶切连接、预扩增、选择性扩增、银染等试验过程，成功建立了牡丹品种AFLP银染反应体系。得到了清晰的指纹图谱，对扩增结果进行聚类分析，得到了23个牡丹品种的聚类分析图。