基于TCGA数据初步筛选胃癌预后相关基因

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目的通过对TCGA数据库中胃癌高通量测序数据进行分析,寻找新的胃癌预后相关的基因,为后续研究提供数据支持。方法下载TCGA数据库中375例胃癌组织和45例癌旁组织中的RNA-seq表达矩阵数据及患者相关临床资料信息,基于R语言进行数据整理与合并后统一标准化分析。利用edgeR和DEseq软件包进行基因表达差异分析;结合患者临床资料,利用单因素和多因素COX回归函数对筛选得到的差异基因进行生存分析并筛选出具有临床意义的基因。结果通过edgeR和DEseq分析后交集得到364个基因。随后对其功能富集发现这些基
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