【摘 要】
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我们利用特定位点扩增片段测序技术(specific-length amplified fragment sequencing,SLAF-seq)对籼稻窄叶青8 (ZYQ8)和粳稻京系17 (JX17)构建的双单倍体(doubled haploid,DH
【机 构】
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南昌大学生命科学学院,江西省分子生物学与基因工程重点实验室,南昌,330031
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我们利用特定位点扩增片段测序技术(specific-length amplified fragment sequencing,SLAF-seq)对籼稻窄叶青8 (ZYQ8)和粳稻京系17 (JX17)构建的双单倍体(doubled haploid,DH)群体进行了简化基因组测序.将DH群体测序数据与水稻参考基因组进行比较分析,获得了70 997个在两个亲本中存在多态性的SLAF标签.通过进一步的筛选,我们利用8 940个高质量的SLAF标签构建了该群体的遗传图谱.图谱覆盖12个连锁群,总图距为2 294 71 cM,标记间的平均图距为0.26 cM.遗传图谱的连锁群与水稻物理图的相关系数统计显示,除了9号连锁群的相关系数为0.87外,其余的1 1个连锁群的相关系数均在0.95以上,表明该图谱的12个连锁群与水稻物理图有很好共线性关系.该高密度图谱的构建为我们进一步研究籼、粳差异基因提供了帮助.
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