【摘 要】
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目的 利用Link-test统计方法整合分析基因芯片和蛋白质质谱分析数据寻找骨肉瘤血清蛋白标志物.方法 利用基因芯片检测从骨肉瘤细胞系(MG-63、Saos-2和U-2OS)中筛选骨肉瘤候选
【基金项目】
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上海市自然科学基金;同济大学优秀青年课题
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目的 利用Link-test统计方法整合分析基因芯片和蛋白质质谱分析数据寻找骨肉瘤血清蛋白标志物.方法 利用基因芯片检测从骨肉瘤细胞系(MG-63、Saos-2和U-2OS)中筛选骨肉瘤候选标志基因;运用蛋白质质谱分析技术分析27个骨肉瘤患者血清标本及47个健康人的血清标本,从中筛选差异具有统计学意义的蛋白质质谱峰;采用Link-test统计方法对筛选到的骨肉瘤候选标志基因和蛋白质质谱峰进行相关性分析,得到交叉验证的骨肉瘤血清蛋白标志物;运用免疫印迹法比较一种候选血清蛋白标志物在骨肉瘤患者和健康人血清中的含量差异.结果 利用基因芯片检测到653个候选骨肉瘤标志基因,蛋白质质谱分析筛选到6个蛋白质质谱峰.经Link-test统计分析,共鉴定出13个候选骨肉瘤血清蛋白标志物,其中包括细胞色素C (Cytochrome cl,CYC-1).在13个候选蛋白质标志物中,12个在骨肉瘤中表达上调,1个表达下调.免疫印迹实验发现CYC-1在骨肉瘤患者血清中的含量明显高于健康人,差异具有统计学意义.结论 利用Link-test统计方法整合分析基因芯片和蛋白质质谱分析数据是寻找骨肉瘤血清蛋白标志物的有效方法,共发现13个候选骨肉瘤血清蛋白标志物.
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