【摘 要】
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[目的]分析SELL基因的基因表达情况、CpG岛、启动子、转录因子结合位点;分析SELL蛋白的亚细胞定位、同源性、理化性质、信号肽和跨膜区域、蛋白质二三级结构及相互作用蛋白.[
【机 构】
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大理大学基础医学院,云南大理671000
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[目的]分析SELL基因的基因表达情况、CpG岛、启动子、转录因子结合位点;分析SELL蛋白的亚细胞定位、同源性、理化性质、信号肽和跨膜区域、蛋白质二三级结构及相互作用蛋白.[方法]利用Promoter2.0、MethPrime、AliB-aba2.1、ProtParam、ProtScale、Clustal Omega、PSORTII、SignalP4.1、TMHMM、SWISS-MODEL、STRING 等生物信息学软件对SELL进行系统分析.[结果]SELL基因至少含有1个启动子,启动子区不存在CpG岛.SELL基因在人体多种正常组织中均有表达,在全血中表达最高.SELL蛋白是有信号肽由372个氨基酸组成的、有跨膜区域的亲水蛋白.主要定位于细胞质和细胞核,二级结构以随机卷曲为主.分析结果显示SELPLG、MADCAM1、CD34、CD44、PTPRC、CD69、CCR7、ITGAM、FOXP3、IL7R蛋白可能与SELL蛋白存在相互作用.[结论]对人SELL基因和编码蛋白进行生物信息学分析,获得了基因的特征及蛋白发挥的功能.
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