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低离子强度和生理酸度下，藏红Ｔ（ＳＴ）与核酸的作用随ＳＴ与核酸的摩尔比（Ｒ）变化具有３种荧光特性，表现出３种结合机理．当Ｒ＞０３３，ＳＴ的荧光为核酸线性猝灭，最大激发波长发生紫移，但发射波长不变，是ＳＴ在核酸分子表面进行长距组装；Ｒ在０３３～０１３范围内，ＳＴ的荧光虽为核酸猝灭，但没有线性关系，表现为ＳＴ在核酸分子表面的组装与嵌入核酸碱基对结合处于微弱的平衡状态；当Ｒ＜０１３，ＤＮＡ体系产生新荧光，荧光激发峰红移，而发射波长仍保持不变，对应于ＳＴ嵌入核酸的双联碱基对之间，而ＲＮＡ体系却没有新的荧光产生．