【摘 要】
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从功能模体水平上,探索沼泽红假单胞菌相似菌株间功能差异的机理.利用循环遍历算法和Python特有的字典数据格式,编写脚本test.py和difference analysis.py,筛选沼泽红假单胞菌CGA009和YSC3差异功能模体.沼泽红假单胞菌CGA009独有14种功能模体,功能主要集中在DNA复制、合成、修复、重排和结构稳定;蛋白质合成;呼吸链的电子转移;细胞的增殖和分化;生长和繁殖;代谢途径的补充;离子运输;清除毒性物质甲基乙二醛.沼泽红假单胞菌CGA009独有5种功能模体,功能主要集中在重金属
【机 构】
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江西中医药大学博士后流动站/正邦集团有限公司博士后工作站,江西南昌330000;南昌师范学院生物技术研究院/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌330000;南昌师范学院生命科学学院,江西南昌3
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从功能模体水平上,探索沼泽红假单胞菌相似菌株间功能差异的机理.利用循环遍历算法和Python特有的字典数据格式,编写脚本test.py和difference analysis.py,筛选沼泽红假单胞菌CGA009和YSC3差异功能模体.沼泽红假单胞菌CGA009独有14种功能模体,功能主要集中在DNA复制、合成、修复、重排和结构稳定;蛋白质合成;呼吸链的电子转移;细胞的增殖和分化;生长和繁殖;代谢途径的补充;离子运输;清除毒性物质甲基乙二醛.沼泽红假单胞菌CGA009独有5种功能模体,功能主要集中在重金属铜的抗性、降解生物胺、调节生物节律和光周期.沼泽红假单胞菌CGA009对紫外线和化学试剂具有抵抗能力,DNA骨架结构更稳定,生长和繁殖性能更强.沼泽红假单胞菌YSC3,对光照反应更加敏感,对重金属铜具有抵抗能力,能够降解生物胺,生存能力更强.本研究编写的Python脚本,广泛适用于细菌、真菌、动物、植物等所有物种.
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