【摘 要】
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白芨(Bletilla striata)具有较高的药用、经济和观赏价值,但是其基因组和转录组序列未知,严重影响了其的研究开发和利用.本研究采用His4000测序平台对白芨的全株进行了转录组
【机 构】
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四川农业大学园林研究所,成都,611130;四川理工学院生物工程学院,自贡,643000;山东烟台工贸技师学院旅游商贸系,烟台,264003;四川农业大学生态林业研究所,成都,611130
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白芨(Bletilla striata)具有较高的药用、经济和观赏价值,但是其基因组和转录组序列未知,严重影响了其的研究开发和利用.本研究采用His4000测序平台对白芨的全株进行了转录组测序分析,共获得原始数据6.8 G,有效数据6.7 G,243 410条Unigene,经过与NR、GO、KOG及KEGG等数据库进行比较分析后,83 541条Unigene被注释到NR数据库,50 178条Unigene被注释到GO数据库,10 007条Unigene在KOG数据库获得注释,43 637条Unigene在Swissprot数据库获得注释,15 321条被注释到KEGG代谢途径中,2 021条Unigene参与了糖类代谢,1 309条Unigene参与了氨基酸合成和代谢,120条Unigene参与了萜类合成,106条转录因子与代谢相关;微卫星位点有31 958个,其中单核苷酸最多,15 709个,占49.16％,其次为二核苷酸和三核苷酸,分别有9 145个和7 104个,占28.62％和22.23％.本研究为白芨的重要功能基因挖掘、遗传育种及其研究开发提供了参考和依据.
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