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“十一五”时期是中国工业企业实现由“中国制造”向“中国创造”跨越的重要战略机遇期，我国工业企业研发效率到底如何，备受社会各界的关注。本文运用DEA方法对我国工业企业研发效率进行测度。研究表明，我国工业企业研发创新的综合效率整体偏低，仍有较大的提升空间，且较低的纯技术效率是导致综合效率不高的主要原因；研发效率整体呈现进步性变化，大多数行业的全要素生产率呈现正增长，且增长的动力主要来源于技术进步，但效率改善的作用并不明显；从差量分析结果看，投入冗余率较低，而产出不足率较高。针对以上研究结论提出了改善我国工业企业研发效率的相关建议，为“十二五”时期我国工业企业提高研发效率、完善研发资源配置结构提供参考。