【摘 要】
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植物的几丁质酶与其抗病能力、防御反应和生长发育密切相关。通过检索华中农业大学公布的柑桔基因组数据网站，发现了32个几丁质酶基因，使用生物信息学软件对这些基因进行分子量、等电点、信号肽、细胞定位、转录谱、保守结构域、系统发育树等方面进行研究。结果表明，该家族基因中有26个成员在染色体上的定位明确，其余6个的位置尚未确定。这些几丁质酶基因家族成员的蛋白分子量、氨基酸残基和等电点分别在14.8～72.7
【机 构】
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肇庆学院果树研究所/肇庆学院生命科学学院
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植物的几丁质酶与其抗病能力、防御反应和生长发育密切相关。通过检索华中农业大学公布的柑桔基因组数据网站，发现了32个几丁质酶基因，使用生物信息学软件对这些基因进行分子量、等电点、信号肽、细胞定位、转录谱、保守结构域、系统发育树等方面进行研究。结果表明，该家族基因中有26个成员在染色体上的定位明确，其余6个的位置尚未确定。这些几丁质酶基因家族成员的蛋白分子量、氨基酸残基和等电点分别在14.8～72.7 kDa、134～636个和4.53～9.21之间。除3个预测蛋白不含信号肽外，其余29个均含有信号肽；在有信号肽的蛋白中，23个蛋白定位在细胞外，6个横跨细胞膜。这些基因在花、叶、果实和愈伤等组织中转录水平相差巨大，有的在几种组织中转录水平都很高，有的在不同组织中转录水平相差很大，有的在所有组织中表达量都很低。用最大似然法对蛋白序列构建系统发育树，结合保守结构域的分析结果，可将这些几丁质酶基因分为4类。第1类的5个编码蛋白都有信号肽且定位在细胞外，含GH18几丁质酶结构域，且有糖基水解酶的功能；第2类的10个编码蛋白都是有信号肽的跨膜蛋白，也有GH18几丁质酶结构域，还有一个丝氨酸/苏氨酸激酶的结构域；第3类的16个编码蛋白都有信号肽且定位在细胞外，有GH19几丁质酶结构域，同时具有溶菌酶的活性；第4类，仅有1个基因（orange1.1t00476.1）,编码的是无信号肽的跨膜蛋白，有GH18几丁质酶结构域，同时具有糖基水解酶的功能，此外还含有抗病蛋白中常见的PPR重复结构域。
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