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提出一种超导故障限流器（SFCL）优化配置的新方法。通过进行短路计算，首先确定安装SFCL能够可靠启动的支路，然后分析SFCL对网络阻抗矩阵的影响，得出短路电流超标点自阻抗对这些支路阻抗参数的灵敏度，根据灵敏度的大小，从中选取安装SFCL的多条候选支路，采用改进的非支配排序遗传算法（NSGA-Ⅱ）这一多目标优化算法对候选支路进行优化计算，实现SFCL的安装位置、数量以及阻抗值的优化配置。最后，通过6节点系统和IEEE39节点系统的仿真验证了所述方法的有效性和可靠性，大大缩小了解的搜索空间，实现了SFCL的优化配置，限制了超标点短路电流水平。