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动物检疫分为进出口检疫和国内检疫2大类。国内检疫指在国内各省、市、县或乡镇地区实行的检疫，可分为产地检疫和运输检疫。前者如集市或牲畜市场检疫，或产地收购检疫，是在贸易过程中进行的，其作用在于避免屠宰病畜，或防止在中转或运输过程中由病畜散布病原，造成原来非疫病地区的传染；后者指交通运输部门对托运的动物及其产品进行检疫，查验产地签发的检疫证书，准予或不准予托运，包括铁路、公路、航空和港口检疫等。