【摘 要】
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为了快速发现与疾病关联的miRNA,基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联m
【机 构】
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东北大学中荷生物医学与信息工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(51171041).国家自然科学基金资助项目(61372014).
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为了快速发现与疾病关联的miRNA,基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联miRNA的疾病,随机游走法是失效的,而PMBP以疾病相似性作为先验信息,能够有效预测;对于已经关联miRNA的疾病,PMBP提高了预测性能,AUC值为0.866.对乳腺癌进行案例分析,预测的前50个miRNAs都被证实与乳腺癌相关,体现了PMBP算法的有效性.
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