本研究以上饶早梨两个品种‘六月雪’和‘黄皮消’试管苗为材料,进行了转录组分析.结果 表明:原始数据进行质量预处理后,BR(六月雪)组和HR(黄皮消)组以及这两组所有样本的有效比分别为91.60％、93.03％和92.32％.与HR组相比,BR组上调的差异基因1 013个,下调的差异基因954个,总数为1 967个.BR组和HR组的RPKM分布范围均为0～5,差异最显著的10个基因分别为PCP025111、PCP026477、PCP0-30457、PCP027061、PCP014174、PCP007177、PCP012213、PCP023677、PCP014786和PCP04450.差异表达基因部分极其显著的GO term有氧化还原过程、铁离子结合、氧化还原酶活性、作用于成对供体、与分子氧掺入或还原、电子载体活性等.差异表达基因部分极其显著的Pathway term有光合作用-天线蛋白、植物激素信号转导、细胞色素P450的外源性化学物质代谢、药物代谢-细胞色素P450等.本研究结果可为上饶早梨六月雪和黄皮消两个品种的鉴定和选育提供理论依据.