【摘 要】
：
目的 通过生物信息学方法分析含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞免疫功能的作用机制.方法 分别收集10例Eftud2髓系细胞特异性敲除(MKO)小鼠及野生型(WT)
【机 构】
：
内蒙古医科大学内蒙古自治区分子生物学重点实验室,内蒙古自治区呼和浩特010058军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所,北京100850;军事科学院军事医学研究院毒物药物研究所,北京100850;解放
论文部分内容阅读
目的 通过生物信息学方法分析含Tu GTP结合结构域延伸因子2(Eftud2)增强小鼠巨噬细胞免疫功能的作用机制.方法 分别收集10例Eftud2髓系细胞特异性敲除(MKO)小鼠及野生型(WT)小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM),经100 ng/mL脂多糖(LPS)刺激2h.采用生物信息学方法对样本进行基因表达差异以及mRNA水平可变剪接差异的检测.分别利用RNA序列差异表达基因(DEGseq)软件包、复制转录本剪接多变量分析(rMATS)软件对两组小鼠BMDM样本中基因表达及可变剪接差异进行统计;利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)分类与富集法统计两组小鼠BMDM样本中基因表达与可变剪接差异所影响的信号通路.结果 与WT小鼠相比,MKO小鼠的BMDM经LPS刺激后白细胞介素6(IL-6)、IL-1β、肿瘤坏死因子α(TNF-α)及与免疫反应相关的基因显著下调;KEGG通路分析表明,BMDM基因表达差异及可变剪接差异主要影响信号转导及免疫系统相关代谢通路,且与磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3 K-AKT)信号通路相关性较强.其中可变剪接差异还存在于泛素化及细胞内吞作用中.与WT小鼠相比,MKO小鼠BMDM可变剪接差异共232处,其中跳过外显子的可变剪接共有125处,占比最多.此外,对可变剪接差异的分析也证实了前期实验结果,即Eftud2可通过影响Toll样受体4/核因子κB (TLR4/NF-κB)信号通路中髓样分化因子88(MyD88)等关键分子的可变剪接,调控相关炎性信号通路的激活,增强巨噬细胞的功能.结论 Eftud2通过影响基因的表达及可变剪接促进巨噬细胞释放炎性细胞因子,从而增强巨噬细胞免疫功能.
其他文献
目的 使用屋尘螨提取物(HDM)建立中性粒细胞为主型小鼠哮喘模型.方法 按照随机数字表法,将16只无特定病原体(SPF)级BALB/c小鼠分为对照组和模型组.模型组给予HDM滴鼻致敏及激
调查研究是领导机关的基本工作方法和领导制度,是每个干部特别是领导干部思想和行动的首要准则。坚持做好调查研究这篇文章,是我们的谋事之基,成事之道。笔者以为,做好调查研
目的 研究异绿原酸A对MH7A人成纤维细胞样滑膜细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的影响.方法 20 μg/L肿瘤坏死因子α(TNF-α)体外诱导MH7A细胞后,加入(0、0.04、0.09、0.13、0.16
2011年11月25日上午9时,中国共产党云南省第九次代表大会在昆明海埂会堂隆重开幕。开幕大会的执行主席是:秦光荣、李纪恒、王学仁、李汉柏、罗正富、杨应楠、仇和、徐荣凯、
党校是培训轮训各级党员领导干部的主渠道和主阵地,是加强干部党性锻炼的熔炉。新时期党校的教学应与时俱进,不断创新,提高教学水平。1目前党校教学存在的主要问题1.1教学针
目的 检测切除小鼠荷瘤淋巴结后肺组织中与白细胞跨内皮迁移相关的趋化因子和黏附分子的表达,同时观察网状纤维改变以及波形蛋白(vimentin)及基质金属蛋白酶9(MMP9)表达情况,
一、营养块育苗方法1、苗床准备:选择适合的育苗场地,做宽度为1.2—1.5米左右的苗床,床底部整平压实,然后平铺一层地膜,在于地膜上铺一层10厘米厚的过筛细土(没用过任何除草
目的 探讨快速动眼期睡眠剥夺(SD)对大鼠不同脑区组蛋白H3的第9位赖氨酸(H3K9)和H3K14乙酰化水平的影响.方法 按照随机数字表法将48只成年雄性大鼠随机分为对照组、睡眠剥夺1
目的 探讨脑络欣通对大脑中动脉闭塞缺血再灌注(MCAO-R)气虚血瘀证大鼠脑血管再生的影响及其可能机制.方法 随机数字表法将SD大鼠分为正常对照组、模型组、脑络欣通高剂量组[